Com a chegada de novos grupos de frades franciscanos vindos de Portugal e com o despertar de novas vocações no Brasil, a Primeira Ordem começou a crescer e a espalhar seus conventos e hospícios em toda a orla marítima. Os “Capuchos” (pobres), como o povo os chamava, dedicavam-se com muito zelo aos índios e colonos. Paralelamente surgiram, quase sempre ao lado de um convento ou hospícios dos frades, uma Ordem da Penitência. As VOTs (Venerável Ordem Terceira) no Brasil foram fundadas nas duas épocas colonial e imperial. De algumas delas, nada sobrou, a não ser ruínas, como se vê em Vitória e Cachoeiro de Macacu. No Estado do Rio de Janeiro, há ainda três Fraternidades Locais da antiga VOT: Angra dos Reis, Cabo Frio e São Francisco da Penitência do Largo da Carioca. Outras Fraternidades Locais, contudo, foram sendo erigidas por todo o Rio de Janeiro.

O início do Regional Sudeste II, Rio de Janeiro e Espírito Santo, está ligado à unificação da Ordem. Na Assembleia de Unificação, em fevereiro de 1972, colocou-se a dificuldade para administrar inúmeras Fraternidades Locais pelo Brasil com um único governo. Era necessária a descentralização. Assim, instituíram-se quinze Regiões. Nos dias 27 e 28 de novembro de 1972, foi criada a VI Região (Rio de Janeiro e Espírito Santo). Nomeado pela Cúpula Nacional Interobediencial, Frei Egberto Prangenberg, OFM, convidou para um Congresso que teve lugar no Convento de Santo Antônio do Largo da Carioca-RJ. As 18 Fraternidades Locais locais seriam cada uma representada por dois Dirigentes leigos e um Padre Assistente. Para cada grupo de 50 membros das Fraternidades Locais locais seria admitido mais um representante. Os congressistas representavam 1.505 professos. Foram palestrantes neste congresso Baltazar M. Batista Pereira, Ruth Azevedo Rocha, Maria das Dores Brandão Bravo e Paulo Machado da Costa e Silva. 

O primeiro Conselho escolhido para a VI Região (Rio de Janeiro e Espírito Santo) teve a seguinte composição: Ministro: Euclides de Almeida Guimarães; 1º Vice-Ministro: Moacyr R. M. Fonseca; 2ª Vice-Ministra: Marilda de Oliveira Cunes; 1º Secretário: Jose Ribamar Moreira Gomes; 2ª Secretária: Maria Rosa Ramos; 1º Tesoureiro: Antônio Praxedes Filho; 2º Tesoureiro: José Aleixo da Silva; Coordenadora de Relações Públicas: Nadyr Duarte Ferreira; Assistente Espiritual Regional: Frei Egberto Prangenberg, OFM; Delegada das irmãs Franciscanas: Irmã Maria Paulina Lellis de Souza.

As reuniões para organização do Regional Susteste II, como Capítulos Eletivos e encontros do Conselho Regional, aconteciam no Parlatório do Convento de Santo Antônio do Largo da Carioca, pois ainda não havia um local fixo. O primeiro Conselho escolhido em 1972 trabalhou ativamente para o crescimento da OFS, realizou cursilhos, cursos para Formadores, Jornadas Franciscanas, no intuito de divulgar o carisma e criar de novas Fraternidades Locais. Assim, em 1991, o Regional Sudeste II-RJ/ES já contava com 26 Fraternidades Locais erigidas canonicamente. Três dessas Fraternidades Locais, contudo, foram extintas; no entanto, outras novas Fraternidades Locais foram erigidas. Em 1998, o Regional Sudeste II era dividido em 3 Distritos, cuja Coordenação cabia aos três Vice-Ministros eleitos. No Capítulo Eletivo de 2005, foram eleitos um Coordenador para cada distrito. O Regional Sudeste II foi dividido em 5 distritos, e atualmente conta com 36 Fraternidades Locais erigidas canonicamente.

(Pesquisa histórica: Maria Tereza da Conceição Ribeiro)